Согласно внесению изменений и дополнений от 3 мая 2021 года к постановлению Главного государственного санитарного врача Республики Казахстан от 23 октября 2020 года № 59 «О дальнейшем усилении мер по предупреждению заболеваний коронавирусной инфекцией в пунктах пропуска на государственной границе Республики Казахстан» сотрудники, не вакцинированные против COVID-19 и не болевшие COVID-19 в течение последних 6 месяцев, переводятся на дистанционный формат работы, за исключением работников, исполнение обязанностей которых невозможно в дистанционном формате.
С апреля 2021 года работники АО "Центр электронных финансов" проходят поэтапно вакцинацию от COVID-19. Первая группа работников уже вакцинирована, планируется второй этап вакцинации. Работникам предоставляется на выбор вакцины Спутник V (Россия) или QazVac (РК). Вакцинирует выездная бригада из Городской поликлиники №9 г.Нур-Султан.